Program Master by Research adalah bagian dari Program Studi Magister Perencanaan Wilayah dan Kota (berbasis kelas), Departemen Teknik Arsitektur dan Perencanaan, Fakultas Teknik yang mengakomodasi minat riset, yang telah lama didiskusikan dan mempunyai banyak contoh di program studi lainnya di luar negeri. Prodi PWK Program Master by Research ini diharapkan mampu mengakomodasi minat mahasiswa di bidang riset dan mampu menjadi sarana pengembangan riset yang lebih berkualitas dan berkelanjutan di Komunitas PWK UGM, serta meningkatkan kuantitas dan kualitas publikasi ilmiah di tingkat internasional.

Kurikulum Prodi PWK Program Master Berbasis Riset (MBR) disusun mengacu pada Kurikulum Tahun 2017 yang diterapkan pada Prodi PWK Program Master Berbasis Kelas (MBK) namun terdapat penyesuaian terminologi dan penawaran mata kuliah menjadi lebih berfokus pada riset.

Pembagian 44 SKS di keempat semester berbeda dengan pembagian SKS pada program MBK. Pada kurikulum MBR mulai dari semester satu hingga empat secara berturut, 44 SKS dibagi menjadi 14, 12,10, kemudian 8 SKS. Meskipun demikian, sama seperti operasional kurikulum MBK yang ada, sangat dimungkinkan apabila mahasiswa dapat menyelesaikan syarat kelulusan dalam tiga semester pada MBR. 

Penetapan dan pembakuan pengelompokkan mata kuliah pada program MBR berbeda dengan kurikulum MBK. Kurikulum MBK hanya terdapat kompleks atau cakupan terkait teori, studio, dan tesis, namun pada MBR kompleks tersebut dibakukan menjadi klaster. Masing-masing klaster tersebut memiliki perbedaan yang signifikan dalam hal tujuan, jenis mata kuliah yang ditawarkan, serta metode penyampaiannya.

Siswa pascasarjana akan menyandang gelar Magister Perencanaan Wilayah dan Kota (M. URP) setelah masa studi 24 bulan yang terbagi menjadi 4 semester (satu semester ditempuh selama 6 bulan) dan matrikulasi selama sepekan penuh sebelum program perkuliahan dimulai.